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关于海洋创新药物筛选与评价平台开展开放共享服务有关事项的通知
来源: 海洋创新药物筛选与评价平台    2018-07-09 12:54:06

各创新单元:

海洋创新药物筛选与评价平台(以下简称:药物平台)联合高性能科学计算与系统仿真平台(以下简称:超算平台)共同搭建完成智能超算耦合生物实测的海洋创新药物筛选技术体系。该体系的建设是青岛海洋科学与技术试点国家实验室(以下简称:海洋试点国家实验室)的重点任务。现基于该技术体系,药物平台对海洋试点国家实验室各创新单元开展开放共享服务。现就对外服务的有关事宜通知如下:

一、服务背景

为解决制约海洋药物发展的药源问题,平台借助海洋试点国家实验室超算平台,多方整合资源,实现了计算机科学、化学和生物医学的跨学科合作,打造了一支“智能超算耦合生物实测”的海洋创新药物开发技术团队,建立了“快速、高效、准确”的海洋创新药物筛选体系。该体系由计算组、化学合成组、生物实测组和人工智能组四个相对独立的小组,通过组间的合作和沟通,形成完整的海洋活性分子筛选开发的技术闭环。该体系经过一年多运行、调试与优化,已经打通了整个研发链条,建成了一系列的数据库,包括可被计算机读取、识别和利用的药物靶点3D数据库、海洋化合物分子精确3D数据库和相对系统完善的具有成药潜力的化合物和对应靶点信息数据库等。同时,通过建立数十种高通量筛选系统和特色实测验证系统,超级计算机仿真模拟筛选的可行性和可靠性亦得以验证,因此,药物平台“智能超算耦合生物实测的创新海洋药物研发技术体系”,现已具备对外开展技术服务的能力。

二、服务内容

1.利用虚拟筛选技术,寻找海洋化合物的作用靶点。

成本费:1元/化合物*靶点。

2.利用大分子相互作用技术,在分子水平鉴定化合物与靶蛋白的相互作用。

成本费:1.2万/芯片。

该项收费按芯片计算,60个化合物/芯片,少于60按1芯片计算。

3.使用体外激酶实验检测化合物在cell-free环境中对激酶的抑制效果。

成本费:100元/孔,或面议。

4.使用MTT法或刃天青法在最适细胞中检测虚拟筛选所得化合物对细胞生长的影响。

成本费:300元/板。

该项收费按板计算,90样品/板,少于90按1板计算。

5.使用荧光素酶检测化合物对靶信号通路下游基因转录的影响。

成本费:2000元/板。

该项收费按板计算,90样品/板,少于90按1板计算。

6.使用最适动物模型对筛选所得的化合物进行药效评估。

成本费:一事一议。

7.其它服务

成本费:一事一议。

三、服务流程

药物平台共享服务流程已经添加到海洋试点国家实验室OA系统,面向各创新单元开放。

Step1.委托人在OA系统中填写并提交《海洋创新药物筛选与评价平台技术服务流程单》(见附件)。

Step2.流程单经过委托人所属创新单元负责人同意后,提报给药物平台主任审批,药物平台主任根据平台年度对外开放共享预算情况,明确是否在预算内,并填写审批意见。并抄送相关业务部门知悉。

Step3.委托人打印相应的流程单,持流程单至药物平台商议具体的技术服务事项及签订技术服务合同。

四、开放共享经费核算

为更好的发挥药物平台的支撑服务职能,海洋试点国家实验室各创新单元作为重点服务对象,对其收费实施预算管理。对于纳入药物平台年度对外开放共享预算支持内的项目完全免费,超出预算的项目适当收取成本费。由项目总体负责人审核成本、安排预算和对外发布。

五、知识产权归属

药物平台承接的技术委托项目,服务过程中产生的知识产权归属原则如下:

化学合成组和生物实测组可视具体情况,与技术服务委托方协商,针对服务内容选择技术委托或合作开发的方式,若双方达成共识采取合作开发的方式,则另行签署合作协议,合作过程中产生的知识产权归双方共同所有;如无特殊说明则归委托方所有。

计算组和人工智能组服务过程中产生的知识产权归委托方所有。

药物平台将充分利用平台的技术与资源优势,通过不断的提升业务水平、加强规范化管理、完善和强化“智能超算生物实测耦合的创新药物筛选与评价技术体系”的特色与优势等方式,为海洋试点国家实验室各创新单元、各高校、科研院所和企事业单位提供优质的服务。

 

附件:《海洋创新药物筛选与评价平台技术服务流程单》


                青岛海洋科学与技术试点国家实验室

                               2018年6月30日


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